胚胎正常發(fā)育需要基因表達的時空調(diào)控。單細胞技術(shù)的發(fā)展使研究早期胚胎調(diào)控具有更高的分辨率，如對小鼠胚胎發(fā)育過程中多數(shù)細胞狀態(tài)的詳細分子定義。德國馬克斯·普朗克分子遺傳學研究所等機構(gòu)揭示小鼠胚胎器官形成初期的時空轉(zhuǎn)錄圖譜。該研究成果于近日發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上，題為：Spatiotemporal transcriptomic maps of whole mouse embryos at the onset of organogenesis。

研究人員使用Slide-seq技術(shù)建立了完整胚胎第8.5天、第9.0天以及部分胚胎第9.5天的空間轉(zhuǎn)錄圖譜。為了支持其實用性，他們開發(fā)了一種工具sc3D，重建和探索三維“虛擬胚胎”以定量研究區(qū)域化基因表達模式。研究人員進一步對神經(jīng)管發(fā)育進行了研究，揭示了神經(jīng)管發(fā)育中背腹軸和頭尾軸上新的差異基因分布具有獨特的空間模式。此外，通過建立Tbx6突變體胚胎，他們利用空間組學驗證了敲除表型的缺失并且被神經(jīng)管替代，并發(fā)現(xiàn)異位神經(jīng)管的分子特征與過去研究有所不同。

綜上，該研究為整個胚胎結(jié)構(gòu)和突變體表型的時空研究提出了新的實驗基礎(chǔ)和計算框架。

注：此研究成果摘自《Nature Genetics》雜志，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場，僅供參考。

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